故事向前追溯到1968年，当学生运动愈演愈烈之际，某大学的医学部出现了一个奇怪的男子。他有着黑白相间的头发，全身到处都是伤痕，而带着伤疤的脸也成为注册商标。这个男人为了获得医师资格证而学习，他的名字是间黑男，并且他通过自己天才的能力，创造了无数的奇迹。并且被后人称为黑杰克。

故事发生在遥远的2061年，网络成为了维系社会平衡不可或缺的存在，并且已经发展到了凭借意识就能够自由连结的地步，然而，网络的极度发达带来的却是个人信息的不断泄露和被篡改，并且因此而引发了一系列严重的社

在未来的某一天，一对男女Retro（山口胜平 配音）和Pandy（本田贵子 配音）在一片荒野中醒来，却发现自己不但赤身裸体而且丧失了记忆。二人来到了东京闹市中肆意抢劫衣服和食物，经过一番大战后，两人被

平成元年四月，辽西中学学生日高一平与对手（同时也是其好友）黑木凯争夺日本武道大赛冠军。比赛正进行到白热化之时，二人被一阵白光包围，同时消失。

来自英国、中国、美国等五个国家的六个孩子来到了小丸子（Tarako 配音）的家乡清水市。来自意大利的安德烈（中川大志 Taishi Nakagawa 配音）暂住在了小丸子的家里。小丸子他们和外国小朋友

铃可是一名时空巡逻员，某日，在巡逻之中，她发现战国时代即将发生打乱，于是决定穿越到那个时代，解除危机，没想到在穿越的过程中，铃可竟然遭到了莫名的敌人的攻击，兵荒马乱之中，铃可来到了二十世纪，刚刚好跌落

知名製藥公司-泰達羅斯（Daidalos）的總部發生了一場爆炸案，一個少年被困在崩落的鋼架中無法脫身，生命危在旦夕。此時，在以不追究無照醫療行為的條件下，黑傑克進行了一場任誰都無法想像的「外科手術」…

故事内容讲述在近未来，主角大地的家庭因父母要离婚而面临破碎，这时突然出现一个神秘人物，他告诉大地：必须同邪恶的外来者斗争，捍卫地球。在地球面临危机前，家庭终于又团结在一起。是一部以“家庭”为主题的科幻

21年前，在未爆炸弹事故中濒死负重伤的间黑男。在不屈的复健治疗中复活，现在作为天才外科医生“黑杰克”活跃在医学界。某天，没有音信的父亲突然出现了。舍弃了母亲和年幼的黑男的父亲在21年后再会。紧接着，黑杰克的家遭人爆破。不久后，黑杰克诞生的背后隐藏着冲击的事实变得明朗。动摇世界的巨大阴谋与他自身命运的战斗现在开始！

1996年全球陷入奥林匹克的狂热中。田径场上、泳池边等等10种以上的竞技，创下一个接着一个的世界纪录。人人疯狂的传递这些消息、这些创下远超过人类的常识范围的记录的选手，被称赞为「超人类」。这时，没有医生执照的黑杰克的电话录音机里，常常听见既未留下性名也未告知病状的女生留言：请务必与我连络，我会为医生准备好空白支票。我的电话号码是…..两年后，「超人类」的出现不仅只限于体育界，音乐、绘画、文学、乃至于物理、科学遍布各个领域，持续于日常生活的话题中独占遨头。而这些消息也传到对世事向来漠不关心的怪医黑杰克的耳中

联合地球历192年，来自外太空的神秘生物入侵地球，它们大肆破坏，屠杀人类，地球变成一片火海，人类文明危在旦夕。